Tacikistan'ın bağımsızlığını ilan etmesinden hemen önce 14 Temmuz 1990'da cumhurbaşkanlığı makamına gelen Kahhar Mahkamov, başkent Duşanbe'de yapılan protestoların ardından 31 Ağustos 1991'de görevinden istifa etti.

Cumhurbaşkanlığından istifasının ardından politikadan uzak duran Mahkamov, 1999'da, yasa gereği eski cumhurbaşkanı sıfatıyla ömür boyu Tacikistan Parlamentosunun üst kurulu olan senato üyesi seçilerek görev yaptı.

Rusya'daki St.Petersburg Madencilik Enstitüsü'nden mezun olan ve kömür ocaklarında çalışma hayatına başlayan Mahkamov, 1982-1985 arasında Tacikistan Sovyet Sosyalist Cumhuriyeti Bakanlar Kurulu Başkanlığı, 1985-1991 arasında da Tacikistan Komünist Partisi liderliği ve 1990'da ise Tacikistan Sovyet Sosyalist Cumhuriyeti Yüksek Konseyi Başkanı olarak görev yaptı.

Kahhar Mahkamov, başkent Duşanbe'de "Sarı Asya" mezarlığında düzenlenecek törenin ardından toprağa verilecek.