26 Ocak 2006, Perşembe. Bir gazetedeki "Askerin iki endişesi" başlıklı manşet gündeme bomba gibi düşüyor. Üst düzey askerî kaynağa atfen bunlar, "1- Bizim için 2007'de kimin cumhurbaşkanı olacağı değil, seçilen kişinin ne yapacağı önemli. 2- Bölücülükle mücadelede geç kalınıyor, politika belirlenmeli" diye sıralanıyor. Askerî Kaynak değerlendirmesini, "Yasalarımız cumhurbaşkanı seçilecek kişinin ya da eşinin nasıl giyinmesi gerektiğini söylemiyor. Bu nedenle Sayın Başbakan'ın, cumhurbaşkanı olması önünde bir engel bulunmuyor. Derseniz ki, kılık kıyafet resepsiyonlarda bir rahatsızlık verirse? Rahatsız olursanız, resepsiyona katılmazsınız olur biter. Asıl önemlisi, cumhurbaşkanlığı koltuğuna oturacak kişinin Cumhuriyet'in temel ilkelerini, Anayasa'nın temel ilkelerini koruma konusunda ne yapacağıdır. Yüksek sorumluluk gerektiren makamlar, çoğunlukla o makama oturan kişinin daha sorumlu davranmasına yol açar" şeklinde sürdürüyor... Siyaset kulislerini dalgalandıran bu haber, Çankaya Köşkü ile Genelkurmay arasında gerginliğe yol açtı. Başbakan Erdoğan ya da eşi başörtülü bir AK Partilinin Cumhurbaşkanı olmasına karşı çıkanlar arasında yer alan dönemin Cumhurbaşkanı Ahmet Necdet Sezer, o gün Genelkurmay Başkanı Org. Hilmi Özkök ile yapacağı haftalık olağan görüşmeyi iptal etti ve bu açıklamayı yapan komutanın bulunmasını istedi. Bunun üzerine Genelkurmay Başkanlığı aynı gün yazılı açıklama yaptı. O sırada Genelkurmay İkinci Başkanı olan Org. Işık Koşaner, "O komutan benim" dedi. Böylece zor zamanda konuşmanın ve sorumluluğu üstlenmenin yaşayan örneği oldu. Şimdi Genelkurmay Başkanı olarak 3 yıl TSK'ya komuta edecek. Tek tip askerlik çıkacak mı? Org. İlker Başbuğ, Genelkurmay Başkanı olarak 29 Nisan 2009'da düzenlediği basın toplantısında askerlik hizmetindeki çeşitliliğe dikkat çekerek, "15 ay normal, kısa dönem ve dövizli askerlik uygulaması var. Daha sade, daha eşit daha adil bir sistem üzerinde çalışıyoruz. Bunları tek tipe indirebilir miyiz, üzerinde duruyoruz" demişti. Başbuğ'un başlattığı çalışma, Genelkurmay Başkanlığı görevini ondan devir alacak olan Org. Işık Koşaner tarafından tamamlanacak. Koşaner'in, terörle mücadele ve profesyonel ordu tartışmalarının gölgesinde nasıl bir uygulamaya imza atacağı merakla bekleniyor.