Kariyerinde ilk olarak 2003-2004 sezonunda Trabzonspor'la, o zamanki  adıyla UEFA Kupası'nda sahne alan Gökdeniz Karadeniz, UEFA Avrupa Ligi ismiyle  devam eden organizasyonda bugüne kadar Trabzonspor'la 8, Rubin Kazan'la ise 39  maça çıktı. 
Tecrübeli futbolcu dün takımının 2-1 mağlup olduğu Sion maçıyla UEFA  Avrupa Ligi'nde forma giyen Türk oyuncular içinde 46 maçla Servet Çetin'i  geçerek, en fazla forma giyen isim unvanını aldı. 
UEFA Avrupa Ligi dışında Şampiyonlar Ligi'nde 22 karşılaşmaya çıkan  Gökdeniz Karadeniz, UEFA Intertoto Kupası'nda da 2 maç oynadı. 
Gökdeniz Karadeniz'in UEFA Avrupa Ligi'nde 12 golü bulunuyor. Hakan  Şükür'le ligde aynı gole sahip Gökdeniz Karadeniz, 3 gol daha bulması halinde  UEFA Avrupa Ligi'nde Hami Mandıralı'nın 15 gollük rekoruna ulaşacak.  
UEFA Avrupa Ligi'nde en fazla forma giyen Türk oyuncular Gökdeniz  Karadeniz ve Servet Çetin'i, Arda Turan (45), Emre Belözoğlu (43) ve Mehmet Topal  (38) izliyor. 
 
Türk futbolcular içinde UEFA Avrupa Ligi'nde en fazla forma giyenler  şunlar:  
 
Futbolcu   Maç   Gol    
 
Gökdeniz Karadeniz 47 12
Servet Çetin 46 1
Arda Turan 45 8
Emre Belözoğlu 43 4
Mehmet Topal 38 3
İbrahim Toraman 37 3
Hakan Şükür 35 12